Voici un script bash (ou zsh) d'une ligne qui permet de faire de l'OCR sur tous les fichiers PDF du dossier courant:

for file in *.pdf; do ocrmypdf --output="pdfa" "$file" "${file%.*}_ocrmypdf.${file##*.}"; done

Version alias à mettre dans votre .bashrc ou .zshrc:

alias ocr='for file in *.pdf; do ocrmypdf --output="pdfa" "$file" "${file%.*}_ocrmypdf.${file##*.}"; done'